学术会议论文提交中的论文查重规则主要包括利用查重软件进行查重、检测论文中的抄袭内容、防止自我抄袭、避免重复发表等。查重软件可以帮助识别论文中的重复内容，确保学术作品的原创性和独立性。

此外，学术会议论文提交中的论文查重规则还包括对引用文献的核实、避免剽窃他人研究成果、规范引用格式等内容。遵守论文查重规则有助于提升学术水平，维护学术道德，确保学术成果的真实性和可信度。