论文查重是学术界非常重要的一环，而选择合适的查重工具更是至关重要。免费的查重工具可能会有一定的局限性，对于修改后的对比也可能不够精准。因此，建议在选择论文查重工具时，不仅要考虑免费与收费，还要关注其准确性和对修改后的对比能力。一些知名的收费查重工具如Turnitin、iThenticate等，可能会更加准确和全面地对比论文的前后修改，但也需要一定的费用投入。

在进行论文查重前后修改对比时，可以先使用免费的查重工具进行初步检测，然后再通过一些收费的查重工具进行更加精准的对比。此外，还可以借助一些论文写作辅助工具，如EndNote、Zotero等，来规范引用格式和文献管理，以减少不必要的重复率。总的来说，选择最合适的论文查重工具需要综合考虑准确性、价格、对修改后的对比能力等因素，以达到最佳的查重效果。